בספרייה כ־37,000 ספרים במדעי היהדות והחברה. הספרייה כוללת שירותי השאלה ומחזיקה את חומר הלימוד הדרוש לכל הקורסים הנלמדים במכון שכטר. נמצא בה מאגר מידע דיגיטלי רחב הכולל את “פרוייקט השו”ת” של בר אילן, מאגר המידע של כתבי יד של התלמוד הבבלי שפותח בידי המכון לחקר התלמוד ע”ש שאול ליברמן, מאגרי מידע של ספריות אוניברסיטאיות , רשימת הספרים המאוחדת, רשימת כתבי העת המאוחדת, רשימת מאמרים במדעי היהדות (רמב”י), המפתח לכתבי עת עבריים ועוד.

ניתן להסתייע בספרנים במציאת ספרים אלקטרוניים, התמצאות במאגרי מידע ממוחשבים, עזרה במציאת מאמרים סרוקים, סיוע בכתיבה ביבליוגרפית. בבניין הכיתות קיים בית מדרש המיועד ללימוד בחברותא ובו אוסף של כ־2,000 ספרי יסוד.